L asym 0.25

2020.06.15-16 Réception des plaques

2020.06.18 Confection des tubes

  • TAE Mg 10x:
    • Tube de 2000uL: TAE 400uL@50x + Mg 250uL@100 + H20 1350uL = TAE 10x + Mg@125mM
  • Tube n°1: little L
    • 5uL de vertex #4, #7, #17, #20, #24, #31, #34, #37, #48, #52, #53, #55, #67, #68, #70, #83, #85, #98 (18 x 4 strands = 72 strands) = 360uL
  • Tube n°2: 50uL = 5uL TAE Mg 10x + 5.4uL tube1 + 39.6uL H2O cuit à gauche (~24h 90°C > 15min > 50°C >-0.5°C/15min > 30°C > 8h)
  • Tube n°3: 50uL = 5uL TAE Mg 10x + 5.4uL tube1 + 39.6uL H2O cuit au milieu (plateau à 33.5°C)
  • Tube n°4: 50uL = 5uL TAE Mg 10x + 5.4uL tube1 + 39.6uL H2O cuit à droite (plateau à 37°C)
  • Plaques SHORT
    • Tube n°5: 5uL de chaque strand de la plaque n°1 Short
    • Tube n°6: 5uL de chaque strand de la plaque n°3 Short
    • Tube n°7: 5uL de chaque strand de la plaque n°4 Short
    • Tube n°8: 5uL de chaque strand de la plaque n°5 Short
    • Tube n°9: 5uL de chaque strand de la plaque n°2 Short
  • Plaque LONG BA
    • Tube n°10: 5uL de chaque strand de la plaque n°1 Long BA
    • Tube n°11: 5uL de chaque strand de la plaque n°2 Long BA
    • Tube n°12: 5uL de chaque strand de la plaque n°3 Long BA
  • Sommets individuels
    • Tube n°13: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #1 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°14: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #14 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°15: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #24 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°16: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #29 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°17: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #30 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°18: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #37 + 80uL H2O = 100uL@10uM
    • Tube n°19: 5uL de chacune des 4 strands du sommet #38 + 80uL H2O = 100uL@10uM
  • Stock Freezer:
    • Sommets individuels:
      • Tube n°20 = 50uL de n°13 vertex#1
      • Tube n°21 = 50uL de n°14 vertex#14
      • Tube n°22 = 50uL de n°15 vertex#24
      • Tube n°23 = 50uL de n°16 vertex#29
      • Tube n°24 = 50uL de n°17 vertex#30
      • Tube n°25 = 50uL de n°18 vertex#37
      • Tube n°26 = 50uL de n°19 vertex#38
    • Plaques Short:
      • Tube n°27 = 240uL de n°5 (short 1)
      • Tube n°28 = 240uL de n°6 (short 3)
      • Tube n°29 = 240uL de n°7 (short 4)
      • Tube n°30 = 100uL de n°8 (short 5)
      • Tube n°31 = 240uL de n°9 (short 2)
    • Plaques Long BA:
      • Tube n°32 = 240uL de n°10 (Long BA 1)
      • Tube n°33 = 240uL de n°11 (Long BA 2)
      • Tube n°34 = 240uL de n°12 (Long BA 3)

2020.06.19-07.23

  • Tube T2' dilué à 1:2000: 5uL de T2 (little L) dilué à 1:200 + 5uL TAEMg 10x + 40uL H20 → concentration des strands estimée à 0.15nM mis à cuire le 2020.06.19 à 19:00 pour 2 semaines (cf courbe ci-dessous)
  • Tube L-all à ~200nM: 5uL de T5, T6, T7, T9 et 2.3uL de T8 + 5uL TAEMg 10x + 23.7uL H20 mis à cuire avec le tube ci-dessus
  • courbe de température suivie: 90°C (15min) → 50°C →[-0.5°C/15min x40]→ [ 30°C (4h) > 32°C (30s) ] x99 (=400h ~17j) → 28°C (hold pendant 3 semaines de plus)
  • Les deux tubes ont été mis au frais le 2020.07.23 à 17:00 dans des tubes sans étiquette

2020.06.26

Prélèvement d'un échantillon de T2' (20uL prélevé) et de L-all (10uL prélevé) au bout d'une semaine de cuisson.
Imagerie AFM peu lisible pour L-all, concentration toujours trop élevée, même dilué 1:500, il faut sans doute diluer encore un peu plus.
Pas d'imagerie de T2'