Publications de recherche / List of Publications

Publications triées par thèmes / Thematic List of Publications

Publications triées par type / List of Publications per type of publication

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Grants and Projects

Thèmes de recherche / Research themes

• Signal processing on and of Graphs: Graph Signal processing ; Machine Learning with Graphs ; Complex Networks ; Dynamical networks
  Social Networks ; Transportation ; Sensor Networks
  
• Signal processing, especially for Nonstationary and/or Multiscale Signals: Time-Frequency, Time-Scale, Wavelets, Empirical Mode Decomposition, Lamperti trans- form, Mellin transform; data-driven methods
• Signal processing and Machine Learning in Physics, Biophysics, or Biomedical:: Turbulence, LES simulations, Inverse problems in physics, applications in Climate modeling, in Genomics; Neuroscience, Epilepsy
• Applications of Signal Processing and study of data on graphs: Data science for transporation (and Bike Sharing Systems); for economics and cliometry; for study of human activities; in neuroscience
• Networking and Anamaly detection in Internet Monitoring
  statistical modeling, traffic classification, anomaly detection.

PhD Candidates that I supervise(d) or co-advise(d)

• Jun Xiao (co-supervised by P. Flandrin & Z. Zheng, PhD defended at LP ENSL, 2005-2008), PhD Thesis on "Contributions to Nonstationary Spectrum Estimation and Stationarity Tests in the Time-Frequency Plane"; J. Xiao was a time lecturer in Physics in Texas State University, Austin (TX, USA), and now lecturer in San Marcos, Texas (USA)).
  
• Nicolas Tremblay (supervised by P. Borgnat, PhD candidate from 09/2011, PhD defended in 10/2014). Phd Thesis: "Réseaux et signal : des outils de traitement du signal pour l’analyse des réseaux". Nicolas Tremblay was awarded the "Prix de Thèse 2015 Signal, Image et Vision du Club EEA, du GRETSI et du GdR ISIS". After a post-doc in the PANAMA project, Inria Rennes, Nicolas is CR CNTRS at GIPSA-lab, Grenoble.
  
• Aude Costard (co-supervised by O. Michel and P. Abry, with S. Achard, Phd candidate at GIPSA-lab from 20/2011. PhD defended in 11/2014). Now working in a private company. PhD Thesis: "Estimation de la structure d’indépendance conditionnelle d’un réseau de capteurs. Application à l’imagerie médicale."
  
• Ronan Hamon (co-supervised by C. Robardet and P. Flandrin, PhD candidate at ENS de Lyon from 10/2012, PhD defended in 09/2015). PhD thesis: "Etude des réseaux dynamiques. Application au système Vélo’v". Then post-doc at LIFI, Marseille; post-doc at CMRS, La Spezia, Italy. Thesis Award: Best thesis in "Gestion des Infrastructures des Transports" by Chaire Abertis Ecole des Ponts IFSTTAR, 2015.
  
• Gabriel Michau (co-supervised by E. Chung and P. Abry, with A. Nantes, PhD candidate since 07/2013 at QUT, Australia). PhD thesis: "Link dependent origin-destination matrix estimation: nonsmooth convex optimisation with Bluetooth-inferred trajectories". Now at Wissenchaftlicher Mitarbeiter, Zurich University of Applied Sciences. Thesis Award: Best thesis in "Gestion des Infrastructures des Transports" by Chaire Abertis Ecole des Ponts IFSTTAR, 2016.
  
• Sarra Ben Alaya (co-supervised with P. Gonçalves, PhD candidate at LIP, ENS de Lyon, 11/2015-09/2016 ; thesis stopped before completion; Sarra moved to a private company as Data Scientist)
  
• Marine Roux (co-supervised by S. Achard, P. Borgnat, I. Gannaz and E. Roquain; 01/2015-09/2018) ; PhD Thesis: "Graph Inference by Multiple Testing with Applications to Neuroimaging" Lien vers la thèse en ligne.
  
• Harry Sevi (supervised by P. Borgnat, with G. Rilling at CEA Grenoble, 11/2015 to 22/11/2018) PhD Thesis: "Analyse harmonique sur graphes dirigés et applications : de l'analyse de Fourier aux ondelettes" Lien vers la thèse en ligne.
• Gaëtan Frusque (co-supervisé par P. Gonçalves, P. Borgnat, thèse 10/2017-12/2020)
  PhD Thesis: "Inférence et décomposition modale de réseaux dynamiques et neurosciences" Page LinkdIn.
  
• Amélie Barbe (co-supervisée par P. Gonçalves, P. Borgnat, M. Sebban, thèse du 09/2018 au 12/2021) : "Diffusion-Wasserstein Distances for Attributed Graphs"
  
• Yacouba Kaloga (co-supervisé par A. Habrard, P. Borgnat, I. Redka, M. Foare, thèse de 10/2018 au 12/2021) : "Apprentissage de représentations de graphes attribués"
  

Other Students or Post-Docs, whom I work(ed) with:

Mikhail Tsitsvero post-doc 05/2017-06/2019, supervised with P. Gonçalves; Labex MILyon
Sarah de Nigris 06/2017-06/2018, post-doc avec P. Gonçalves et P. Abry dans le projet ANR GRAPHSIP
Rémy Cazabet 09/2015-09/2016, post-doc at LPENSL (ANR Vel’Innov)
Guillaume Lozenguez, from 11/2013 to 11/2014, post-doc at LPENSL (ANR Vel'Innov), now assistant professor, Ecole des mines de Douai
Jérémy Schmitt, agrégé préparateur ENS de Lyon at LPENSL from 09/2012 to 09/2015. Project about EMD (and 2D-EMD). Now Lecturer in Lycée, BTS, in Nice.
Hirochika Asai (Esaki Lab., Tokyo Univ., PhD. defended with H. Esaki and K. Fukuda, 2013)
Guillaume Dewaele, post-doc et Agrégé Préparateur 2005-2009, maitenant Prof. Agrégé en CPGE. Publications
Hassan Amoud (post-doc, StaRAC project, 2009-2010)
Elyès Ben Hamida (PhD. defended w/ E. Fleury, 2009)
Adrien Cahuzac (PhD. defended w/ E. Lévêque and J. Boudet, ECL; Lyon, 2012)
Florent Chatelain (PhD. defended w/ J.-Y. Tourneret, 2007)
Douglas Baptista de Souza (PhD defended at GIPSA-lab with Jocelyn Chanussot and Anne-Catherine Favre; GIPSAl-lab, Grenoble, 10/2013)
Romain Fontugne (PhD. defended w/ K. Fukuda; Tokyo, 2011)
Yosuke Himura (alumni of Esaki Lab., Tokyo Univ. 2007.06-2010.03)
Nicolas Larrieu (PhD. defended w/ P. Owezarski, LAAS, 2005)
Patrick Loiseau (PhD. defended w/ P. Gonçalves, LIP, 2009)
Azadeh Moghtaderi (post-doc at LPENSL, StaRAC project, 2009-2010)
Takuya Motodate (Esaki Lab., Tokyo Univ., Master Student)
Pepa Ramirez-Cobo (post-doc at GIPSA-lab, StaRAC project, 2009-2010)
Jean-Baptiste Rouquier (LIP, posdoc IXXI (Lyon); then ISC-PIF (Paris), 2009-2010)
Johan Sandberg (PhD. defended w/ M. Hansson-Sandsten, 2010)
Antoine Scherrer (post-doc, OSCAR project, 2007-2008)

Collaborators (at least, some of them, the list is not fully updated) who are permanent scientists and with whom I worked, in alphabetical order:

Patrick Abry (CNRS, LP ENSL; Lyon)
Pierre-Olivier Amblard (CNRS, GIPSA-lab; Grenoble)
Christophe Baudet (UJF, LEGI; Grenoble)
Alain Barrat (CPT, CNRS; Marseille)
Jérôme Boudet (ECL, LMFA; Lyon)
Kenjiro Cho (NII, WIDE; Tokyo, Japan)
Guillaume Dewaele (Prof. Agrégé CPGE; Angers)
Lyndon Emsley and Anne Lesage (ENSL, CRMN; Lyon)
Hiroshi Esaki (Tokyo Univ., WIDE; Tokyo, Japan)
André Ferrari (Univ. Nice, Lab. Fizeau (OCA); Nice)
Patrick Flandrin (CNRS, LP ENSL; Lyon)
Eric Fleury (ENSL, LIP; Lyon)
Paulo Gonçalves (INRIA, LIP ENSL; Lyon)
Jean-Loup Guillaume (Univ. Paris 6, LIP6; Paris)
Hubert Hansen (Univ Lyon 1, IPNL; Lyon)
Paul Honeine (UTT, ICD; Troyes)
Kensuke Fukuda (NII, WIDE; Tokyo, Japan)
Emmanuel Lévêque (CNRS, LP ENSL; Lyon)
Olivier Michel (Grenoble-INP, GIPSA-lab; Grenoble)
Philippe Owezarski (CNTS, LAAS; Toulouse)
Nelly Pustelnik (CNRS, LP ENSL; Lyon)
Fabio Ricciato (FTW; Wien, Austria)
Cédric Richard (Univ. Nice, Lab. Fizeau (OCA); Nice)
Céline Robardet (INSA Lyon, LIRIS; Lyon)
Stéphane Roux (ENS de Lyon, LP ENSL; Lyon)
Jean-Yves Tourneret (INPT, ENSEEIHT; Toulouse)
Darryl Veitch (CUBIN, Univ. of Melbourne; Australia)
Pascale Vicat-Blanc Primet (INRIA, LIP ENSL; Lyon)

• Projet ACADEMICS (Machine Learning & Data Science for Complex and Dynamical Models)
  Projet financé par l'IDEXLYON (1.2 M€), porteur principal : P. Borgnat, en collaboration avec M. Sebban, C. Robardet, P. Gonçalves, M. Karsai et F. Bouchet, associant 4 laboratoires de l'Université de Lyon : LPENSL, LIRIS, LIP, LabHC. Durée prévue : 2018-2021.
  
• Project DATAREDUX, with groups of Alain Barrat (Marseille), Vittoria Colizza (Paris) and Marton, Karsai (Budapest).
  ANR project to begin 2020-2024.
• Project DARLING, with groups of Cédric Richard (Nice), Romain Couillet (Grenoble), Philippe Ciuciu (Neurospin, Paris)
  ANR project to begin, 2020-2024.

• Projet GRAPHSIP (Traitement de signaux sur graphes)
  Projet ANR (appel Blanc) coordonné par O. Lezoray (GREYC, Caen) ; porteur pour l'ENSL ; 2014-2019. Site du projet
  
• Projet ASTRES (Analyse, Synthèse et Transformations par Réallocation, EMD et Synchrosqueezing).
  Projet ANR (appel Blanc) coordonné par P. Flandrin, 2014-2017.
  
• Projet VEL'INNOV (Les vélos en libre service automatisé. Un système socio-technique innovant et ses appropriations sociales)
  Projet ANR (appel Sociétés Innovantes) coordonné par C. Raux (LET) ; porteur pour l'ENSL, 2013-2016.
• StarAC -- Stationnarité relative et Approches Connexes. ANR blanche (12/2007 - 12/2010) avec Patrick Flandrin (CNRS, ENS Lyon), Cédric Richard (maintenant à l'université de Nice-Sphia Antipolis) & Paul Honeine (UTT) et Pierre-Olivier Amblard (CNRS, GIPSA-LAB).
  
  
• Analyse du "Vélo'v", étude par une approche inter-disciplinaire (signal, systèmes complexes, économie et géographie) des déplacements par les Vélo'v.
  Participants : ENS de Lyon (P. Abry, P. Borgnat, P. Flandrin, E. Fleury, P. Jensen, L. Merchez), LIRIS/INSA Lyon (C. Robardet, L. Cerf; J.-F. Boulicot), LET (Lyon 2) (A. Bonnafous, C. Raux), ENSSIB (E. Guichard)
  Activité financée par l'IXXI (Institut des Systèmes Complexes Rhône-Alpes) et l'ENS de Lyon, 2009-2010.
  
  
• Travail de coopération CNRS-JSPS: ``Benchmarking and statistical analysis tools for modern Internet and sensor network traffics''
  Joint-work between the Laboratoire de Physique ENS Lyon and the LIP (UMR CNRS-INRIA-UCBL-ENSL 5668) as the French partners, and The Esaki laboratory at the University of Tokyo (Graduate School of Information Science and Technology), the NII (Fukuda Lab') & IIJ (Internet Initiative Japan) as the Japanese partners.
  This was an activity specifically funded in 2010 and 2011, that is ongoing on a slower rythmn.
  
  
• Participation in TMA: data Traffic Monitoring and Analysis, COST TMA Action IC0703. 2007/11 - 2012/03.
  
  
• CNRS-WIDE Collaboration -- Japan-France Collaboration on Mobility and Measurement topics for Internet. 2005-2008.
  Collaboration with the NII (Japan) and IIJ.
  
  
• OSCAR -- Overlay Network Security, Characterization and Recovery. Collaboration dans le cadre de l'appel pré-compétitif ANR-RNRT (leader : France Telecom) 04/2006-04/2008.
  
  
• MetroSec -- Métrologie pour la Sécurité et la Qualité de Serv ice
  Analyse du trafic internet et de ses anomalies. Collaboration financée par l'ACI Informatique & Sécurité, 10/2004-10/2007.